Kết hợp mô hình phân tử và protein docking trong thiết kế chất ức chế yếu tố đông máu hoạt hóa Xa mang khung isosteviol

Tóm tắt

Đặt vấn đề: Thiết kế các hợp chất phân tử nhỏ có khả năng ức chế yếu tố đông máu hoạt hóa Xa (FXaI) được xem là một trong những hướng đi chính nhằm tìm kiếm liệu pháp điều trị các rối loạn thuyên tắc huyết khối.
Mục tiêu nghiên cứu: Ứng dụng phương pháp silico trong thiết kế các dẫn xuất isosteviol mới hướng tác dụng ức chế FXa.

Phương pháp: Mạng nơ ron nhân tạo được sử dụng để xây dựng các mô hình liên quan định lượng cấu trúc-hoạt tính sinh học (QSAR) nhằm dự đoán tác dụng ức chế FXa. Mô phỏng docking phân tử được áp dụng để dự đoán khả năng liên kết của các hợp chất đối với FXa.
Kết quả nghiên cứu: Mô hình QSAR áp dụng thuật toán mạng perceptron một lớp với cấu trúc 5-8-1 xây dựng trên 77 cấu trúc isosteviol cho hệ số xác định trên tập huấn luyện (R2) là 0,93 và trên tập đánh giá ngoài là 0,84. 16 dẫn chất mới của isosteviol được thiết kế có năng lượng liên kết với FXa dao động từ -9,1 tới -6,9 kcal/mol. Từ các chất mới thiết kế, 5 chất được xác định có hoạt tính mạnh nhất.
Kết luận: Các chất mới thiết kế thể hiện hoạt tính tốt, là cơ sở lý thuyết cho tối ưu hóa cấu trúc và phát triển thuốc chống đông máu mới hướng ức chế FXa.